gem install pg (bundle install) したらバインディングがシステム標準の PostgreSQL に対してビルドされてしまい Homebrew でインストールした PostgreSQL に Rails アプリケーションから接続できないときの対処法

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これに似ていてエラーメッセージとかも同じ感じだが rake db:migrate とかができない、という場合。

PATH の関係で /usr/bin/pg_config が /usr/local/bin/pg_config より優先される（または /usr/local/bin/pg_config にパスが通っていない）のが一因なので、 PATH を書き換えてから bundle install すればよい。

$ gem uninstall pg
$ export PATH=/usr/local/bin:$PATH
$ bundle install

もしくは、 pg gem をインストールするとき --with-pg-config オプションで /usr/local/bin/pg_config を指定する、というのが一般的のようだ（Bundler を使う場合は Ruby - bundlerでpgをインストールする - Qiita のようにする）