すんなりいかずに GNOME が動かなかったりするんじゃないかとドキドキしていたけど、一日放置してたらうまくいっていた。
xscreensaver が死んでスクリーンのロックを解除できなくなっていたので CTRL+ALT+F2 とか押して別コンソールをたちあげて root でログインして xscreensaver を kill してまた切り替えたら今度はマウスカーソルがなくなっていてキーボード操作も無効になっていたのでもう一度切り替えて reboot した。
genkernel 2.6.23 とかがあったのでそのうち make oldconfig を試してみよう。あとやっぱり gnome-screensaver と epiphany (とその依存で firefox) が入ってしまう。 firefox はせっかくなので -bin を消した。 gnome-screensaver は xscreensaver を消しても全然画面のロックができないなぁ。